Российская Таможенная служба получит полномочия по осуществлению функций Россельхознадзора и Роспотребнадзора. Первоначально санитарный и ветеринарный контроль перейдут ФТС на основании эксперимента, который будет проводиться лишь в нескольких таможенных пунктах страны. В зависимости от полученных результатов эксперимента Госдума примет решение о том, каким службам в дальнейшем предстоит выполнять данные функции.
Ожидается, что эксперимент положительно повлияет на сроки осуществления таможенных операций в пунктах пропуска. Сторонники Эксперимента отмечают, что переход функций позволит упорядочить работу госорганов на границе. Противники заявляют, что эксперимент может негативно сказаться на качестве проводимых проверок.